GBIF zavedl nový Phylogenetic Explorer na portálu Legume Data Portal, který je projektem fylogenomické pracovní skupiny pro luštěniny. Tento vizualizační nástroj, který byl vydán na podporu úvodních přednášek na 8. mezinárodní konferenci o luštěninách (8ILC) v brazilském Pirenópolisu 6. srpna 2023, nabízí nový pohled na data o výskytu druhů ze sítě GBIF a uspořádává je v souladu s aktuálními fylogenetickými důkazy o evolučních vztazích mezi druhy v rámci velké, kosmopolitní čeledi luštěnin.
Výchozí zobrazení v experimentálním nástroji představuje data o výskytu zprostředkovaná GBIF, která jsou sladěna s nedávno publikovanou fylogenezí caesalpinioidních druhů luštěnin(Ringelberg et al. 2023). Uživatelé mohou procházet a vybírat záznamy pro 1 860 druhů na vrcholech stromu a také pro některé taxony vyššího řádu na spojích ve větvích. Všechny taxony jsou přiřazeny k páteřní taxonomii GBIF, takže mapa zobrazená pro jednotlivé druhy ve fylogenezi odpovídá mapě druhů dostupné na GBIF.org.
Novinka prohlížeče spočívá ve schopnosti mapovat výskyt pro celý klad nebo skupinu taxonů spojených jedním společným předkem jediným kliknutím. Uživatelé mohou také vybírat a porovnávat více kladů, včetně blízce příbuzných sesterských kladů, procházet fylogenetický strom, měnit zobrazení a barvy mapy a stahovat vybrané výskyty. Toto pokračující výzkumné a vývojové úsilí vychází ze zkušeností získaných ze dvou předchozích projektů, PhyloJive a PhyloLink.
"Fylogenetický průzkumník představuje velkou, ekologicky významnou a celosvětově rozšířenou čeleď, která může sloužit jako testovací příklad pro systematiky z celého světa," řekl. Anne Bruneau z Montrealské univerzity. "Naše pracovní skupina pracuje jako komunita od roku 2010 na usnadnění a šíření výzkumu systematiky, taxonomie a biodiverzity luštěnin, takže jsme z těchto pokroků nadšeni."
Datový portál pro luštěniny, podporovaný společnostmi Canadensys a GBIF, funguje jako instance hostované portálové služby GBIF. Členové pracovní skupiny použili první verze prohlížeče na podporu komunitní kurátorské práce, což vedlo k publikování první verze globálního kontrolního seznamu luštěnin, který byl schválen komunitou a který zlepšuje přesnost údajů o výskytu, biologické rozmanitosti a taxonomii. Po tomto prvním veřejném vydání se plánuje další vývoj a partnerství, takže připomínky a zpětná vazba uživatelů jsou vítány na phylogeny@gbif.org.
"Jsem přesvědčen, že tento posun v pohledu na klasifikaci založenou na DNA otevře nové možnosti výzkumu," řekl. Joe Miller, výkonný tajemník GBIF. "Stejně vzrušující je však i příslib, že toto technické výzkumné a vývojové úsilí přímo podpoří politicky relevantní ukazatele fylogenetické rozmanitosti."